La construction du nouveau bâtiment du monastère de Santa Clara à Coimbra a été lancé en 1649. Ancien monastère, construit à la fin du XIIIe siècle, a été détruit, et il a été décidé de construire un nouveau bâtiment pour les religieuses de l'Ordre de Santa Clara.

Le projet a développé un moine bénédictin du monastère et de l'architecte royal João Turriano, en charge de la construction de l'architecte royal Mateus do Couto. Nouvelle construction a duré assez longtemps. En 1677, un nouveau bâtiment du monastère, qui est devenu connu comme le Monastère de Santa Clara-a-Nova, conduit religieuses. En 1696, l'église fut consacrée.

Le portail principal de l'église du monastère est décoré avec le blason royal, qui est soutenu par deux anges. L'intérieur de l'église est de style baroque. L'église a une seule nef, transept est manquant. Les chapelles latérales et la chapelle principale est décorée avec 14 retables du XVII siècle dans le style de "Talya Dorado" - retables encadrées de bois sculpté et doré. En outre, un nouveau monastère a été déplacé tombe avec les restes de la reine Isabelle de Portugal, le fondateur du monastère. Après la mort de son mari, le roi Dinis, la reine était à Coimbra couvent de Santa Clara jusqu'à sa mort et a été enterré là. Par conséquent, parmi les habitants ce monastère est appelé le monastère de la reine Isabelle. Le tombeau de cendres, en argent et cristal, situé près de l'autel principal de l'église. Devant l'église se dresse un monument à la reine Isabelle, par le sculpteur Antonio Teixeira Lopes dans le XIX siècle.

En 1733, dans le cloître du monastère ont été construits dans le style Renaissance. La construction de ces galeries en charge de l'architecte hongrois Carlos Mardel.