Lorsque les troupes coloniales espagnoles ont commencé la conquête du Pérou, Cuzco a été l'un des bastions de la puissance de l'Empire Inca. Ses habitants sont farouchement défendus, le double de la ville passa de main en main avant les Incas se sont retirés en 1536. L'Eglise catholique a réagi très sérieusement à la construction de la cathédrale dans une telle importante ville coloniale de la région. Cathédrale de Saint-Domingue, il est appelé la cathédrale de l'Assomption de la Bienheureuse Vierge Marie, il a été construit avec soin et attention au détail, et la poursuite de la construction de plus d'un siècle. Aujourd'hui, la cathédrale est l'une des destinations touristiques les plus importantes et les plus populaires à Cusco, et en raison de sa grande importance dans l'histoire de la ville, et à cause de sa belle architecture.

Lors de l'arrivée des conquistadors espagnols à Cuzco, les temples les plus importants et de premier plan dans la ville était Coricancha - temple dédié au dieu soleil Inti. Beaucoup d'historiens croient que ce fut le temple le plus sacré dans l'Empire Inca. Les Espagnols ont décidé sur le site du temple des Incas pour construire sa cathédrale, et utilisés dans le même temps la plupart des matériaux de construction, en passant par le temple de Coricancha. Aujourd'hui, les visiteurs peuvent encore voir une petite quantité des murs en ruines du temple des Incas près de l'arrière de la cathédrale.

La petite église, connue comme l'église Triumph, construit en 1536, peu après la ville a été conquise. Mais dès que les autorités espagnoles dans ces domaines établis, la ville a commencé à construire une cathédrale beaucoup plus grandiose et impressionnante. Des plans ont été élaborés par l'architecte espagnol Juan Miguel de Veramendi. La cathédrale a été construite dans le style gothique et Renaissance qui était typique de l'architecture religieuse espagnole à l'époque. Bien qu'il existe des signes de la présence de l'Inca influence dans le symbolisme religieux du bâtiment, y compris la tête d'un jaguar sur la porte principale de la cathédrale. La construction de la cathédrale a commencé en 1559. La plupart de la population des Incas a été utilisé pour les travaux lourds lors de la construction du temple.

Pendant des siècles, la cathédrale est devenue le foyer de plusieurs objets religieux importants, y compris la célèbre statue du Christ noir, qui est obscurci par les bougies pendant plusieurs siècles. On croit que cette statue a aidé l'église de survivre et de persister après le séisme dévastateur en 1650. Sur la droite est un grand tour de la cathédrale cloche Maria Angola Bell, 2 mètres de haut, pesant environ 6 tonnes. Sa sonnerie peut être entendu à une distance de vingt miles. La cathédrale a gardé une impressionnante collection d'art couvrant plusieurs siècles, dont des peintures en 1650, qui sont la plus ancienne de la ville.