Zoo et le Musée de la nature à Split ont été donnés à la ville en raison du début du XXe siècle, plusieurs collections naturelles précieuses. Professeur Umberto Dzhirometta en 1923 a soulevé la question de la création du Musée d'Histoire Naturelle. Le conseil de ville de Split a pris la question à l'examen et en 1924 a fondé le premier musée et Dzhirometta est devenu son chef jusqu'à sa mort en 1939.

Dans les premières années de son existence, le musée a été situé dans l'un des bâtiments municipaux dans le centre-ville. Bientôt l'espace ne suffisait pas, et le musée a été transféré à l'un des bâtiments du parc de Marjan. Avec le musée a ouvert un petit zoo, représentant certaines espèces d'animaux indigènes et exotiques. Pour la première dans l'ex-Yougoslavie Aquarium à côté du bâtiment du musée a été construit l'espace supplémentaire. Plusieurs années plus tard, l'océanarium était fermé et transformé en une petite cage. Aujourd'hui à Split Zoo a plus de 300 espèces d'animaux.

Le bâtiment dans le parc de Marjan sur les hostilités en 1991, a été fermée pour des raisons de sécurité. Ensuite, le musée a déménagé dans le Gripe de forteresse, et après 1997, il est retourné à Marian. Après 2000, à la demande des employés pour les besoins du Musée a été alloué un nouvel espace, d'une superficie totale d'environ 1156 mètres carrés, dans laquelle le Musée a commencé à travailler en Janvier., 2002

Avant l'ouverture de la nouvelle directrice du musée a été réorganisé les collections des musées et raconté plusieurs nouvelles expositions (par exemple, la collecte des animaux et des oiseaux empaillés, le département de géologie et la paléontologie, l'entomologie, Département de vertébrés et d'invertébrés, etc.). Ont également effectué des travaux sur le traitement et la systématisation des expositions, le travail de terrain dans la partie centrale de la Dalmatie, de nombreuses expositions au musée et à l'extérieur. En outre, le personnel du musée participe à de nombreuses conférences scientifiques.

Au rez-de-chaussée du musée accueille une variété d'expositions, ainsi que sur les autres étages abritera l'exposition permanente. Tout le monde peut acheter les matériaux supplémentaires musée sur l'histoire du musée et l'histoire naturelle locale.